Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM106BQ9NUM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM106BQ9NUM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms