Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELLSQ9NRZ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELLSQ9NRZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HELLSQ9NRZ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELLSQ9NRZ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms