Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR8Q9NR97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TLR8Q9NR97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TLR8Q9NR97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TLR8Q9NR97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms