Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRTAC1Q9NQ79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRTAC1Q9NQ79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRTAC1Q9NQ79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRTAC1Q9NQ79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms