Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCUBE2Q9NQ36 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms