Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM138Q9NPI0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM138Q9NPI0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM138Q9NPI0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms