Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH12Q9NPG4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDH12Q9NPG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDH12Q9NPG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms