Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHST11Q9NPF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHST11Q9NPF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST11Q9NPF2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms