Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP25Q9NPA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP25Q9NPA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP25Q9NPA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms