Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLMQ9NP87 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLMQ9NP87 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLMQ9NP87 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLMQ9NP87 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms