Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH2D2AQ9NP31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH2D2AQ9NP31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH2D2AQ9NP31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms