Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRMS1Q9HCU9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
BRMS1Q9HCU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRMS1Q9HCU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRMS1Q9HCU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms