Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PLXNA4Q9HCM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLXNA4Q9HCM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PLXNA4Q9HCM2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA4Q9HCM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms