Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMURF1Q9HCE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMURF1Q9HCE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms