Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POPDC3Q9HBV1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POPDC3Q9HBV1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POPDC3Q9HBV1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POPDC3Q9HBV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms