Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPV4Q9HBA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPV4Q9HBA0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms