Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSER2Q9H7U1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCSER2Q9H7U1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCSER2Q9H7U1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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