Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP13A3Q9H7F0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP13A3Q9H7F0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP13A3Q9H7F0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP13A3Q9H7F0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms