Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNCQ9H7C4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNCQ9H7C4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCQ9H7C4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCQ9H7C4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms