Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2D4AQ9H788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH2D4AQ9H788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SH2D4AQ9H788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH2D4AQ9H788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms