Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF41Q9H4P4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF41Q9H4P4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF41Q9H4P4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms