Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCAD1Q9H4L7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCAD1Q9H4L7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCAD1Q9H4L7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms