Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL3Q9H2J4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL3Q9H2J4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL3Q9H2J4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms