Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J1

ARRDC1-AS1, Uncharacterized protein ARRDC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARRDC1-AS1Q9H2J1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms