Protein–RNA interactions for Protein: Q9H237

PORCN, Protein-serine O-palmitoleoyltransferase porcupine, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PORCNQ9H237 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PORCNQ9H237 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PORCNQ9H237 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PORCNQ9H237 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms