Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH19Q9H159 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH19Q9H159 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH19Q9H159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH19Q9H159 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms