Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPL1Q9H0R8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPL1Q9H0R8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms