Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NACA2Q9H009 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NACA2Q9H009 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NACA2Q9H009 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms