Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NYXQ9GZU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NYXQ9GZU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NYXQ9GZU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NYXQ9GZU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NYXQ9GZU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NYXQ9GZU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms