Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP6Q9GZR1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SENP6Q9GZR1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP6Q9GZR1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SENP6Q9GZR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SENP6Q9GZR1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms