Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIP2Q9C0E4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIP2Q9C0E4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIP2Q9C0E4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIP2Q9C0E4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms