Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM6Q9C030 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM6Q9C030 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM6Q9C030 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRIM6Q9C030 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM6Q9C030 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms