Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM9Q9C026 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM9Q9C026 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM9Q9C026 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM9Q9C026 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms