Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF3BQ9BZI7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UPF3BQ9BZI7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UPF3BQ9BZI7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms