Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPEB1Q9BZB8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPEB1Q9BZB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CPEB1Q9BZB8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CPEB1Q9BZB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPEB1Q9BZB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPEB1Q9BZB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPEB1Q9BZB8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPEB1Q9BZB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms