Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TDRD1Q9BXT4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD1Q9BXT4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TDRD1Q9BXT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD1Q9BXT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms