Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REPIN1Q9BWE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
REPIN1Q9BWE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
REPIN1Q9BWE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms