Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM109Q9BVC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM109Q9BVC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM109Q9BVC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM109Q9BVC6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms