Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR18Q9BV38 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR18Q9BV38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
WDR18Q9BV38 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WDR18Q9BV38 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms