Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZBED2Q9BTP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZBED2Q9BTP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZBED2Q9BTP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZBED2Q9BTP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms