Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX7Q9BT81 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX7Q9BT81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms