Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UPK3BQ9BT76 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UPK3BQ9BT76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPK3BQ9BT76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPK3BQ9BT76 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPK3BQ9BT76 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPK3BQ9BT76 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UPK3BQ9BT76 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms