Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SDF4Q9BRK5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDF4Q9BRK5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDF4Q9BRK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SDF4Q9BRK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms