Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRG3Q99928 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRG3Q99928 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRG3Q99928 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms