Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF18Q99633 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF18Q99633 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms