Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCNX1Q96RV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNX1Q96RV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX1Q96RV3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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