Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF12Q96QT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF12Q96QT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF12Q96QT6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF12Q96QT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms