Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8orf48Q96LL4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf48Q96LL4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms