Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PKNOX2Q96KN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKNOX2Q96KN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKNOX2Q96KN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms