Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC41A2Q96JW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC41A2Q96JW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC41A2Q96JW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms